沙棘移植苗定植后至结果前，树冠一般不修剪，只对单茎植株略加截短，以使其萌芽分枝，形成多杆密植树冠。这种树冠能较好地利用营养空间，获得高产，同时，也便于手工摘果。
随着树龄的增长，许多枝条，包括一些骨干枝也会发生干枯，从而影响摘果和田间管理。因此，在结实后，每年要进行卫生修剪，即剪去过密的枝条、病枝、断枝和枯枝。
沙棘是强阳性树种，在侧方郁闭的情况下，结实不良。因此，须对树体进行管理，改善内膛枝的光照条件，使结实部位分布均匀。在状态下，沙棘一般表现为有不明显主干的灌木或小乔木，因此在修剪时，可不培养中心领导干，重点在于主枝的管理和培养。一般地说，可培养2-3层主枝，类似于疏散分层形。
沙棘萌蘖性能强，枝条很发达，因此修剪可在初果期进行。修剪时，将多余的枝条回缩，留下培养的壮枝作主枝。在主枝的******侧枝前端1/2处短截。在顶芽摘心，抑制******优势，矮化树体，促进主枝发育。
层距依树体而定，一般只要能分清层次即可，基层与二层的层距应比二层与三层的层距大1/3左右。各层主枝应交叉分布，以充分利用营养空间。
明显衰退的沙棘园，要进行平茬复壮更新。具体办法是将植株的地上部分剪去，让其萌发新的萌蘖条。为了不间断生产利用，防止水土流失，平茬可在3-5年内隔行轮期完成。
沙棘的修剪宜在休眠期进行，以利于萌生合格的枝条。沙棘为2年生枝条结果，因此须保留足够的枝条。
卫生剪枝和疏花，可在生长期进行。主干和主枝上的花应疏去，因为这些果不易采收，会消耗树体的营养。卫生剪枝着重在于除去衰弱枝、徒长枝、过多的营养枝和过长的枝刺。需要注意的是，生长期的修剪强度不宜过大，否则会引起树势营养生长过旺而影响生殖生长。